Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb1P13372 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb1P13372 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms