Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrm1P12657 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrm1P12657 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrm1P12657 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms