Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn3P06796 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn3P06796 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csn3P06796 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csn3P06796 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csn3P06796 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms