Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcrg-V1P06325 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcrg-V1P06325 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcrg-V1P06325 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms