Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgals6O54891 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgals6O54891 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lgals6O54891 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms