Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn6O35646 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn6O35646 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn6O35646 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn6O35646 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn6O35646 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn6O35646 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn6O35646 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn6O35646 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn6O35646 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn6O35646 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn6O35646 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn6O35646 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn6O35646 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms