Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rundc3aO08576 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc3aO08576 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc3aO08576 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms