Protein–RNA interactions for Protein: L7N280

Gm21962, Predicted gene, 21962, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21962L7N280 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21962L7N280 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21962L7N280 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21962L7N280 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21962L7N280 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21962L7N280 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm21962L7N280 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21962L7N280 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21962L7N280 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21962L7N280 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21962L7N280 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21962L7N280 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21962L7N280 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21962L7N280 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21962L7N280 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms