Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vwa3bJ9JI28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vwa3bJ9JI28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vwa3bJ9JI28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms