Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21900J3QP38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21900J3QP38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21900J3QP38 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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