Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21797J3QNW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21797J3QNW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21797J3QNW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms