Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms