Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r67G5E8C1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r67G5E8C1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r67G5E8C1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms