Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srp72F8VQC1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Srp72F8VQC1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp72F8VQC1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms