Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
5830473C10RikF8VQ07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5830473C10RikF8VQ07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms