Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp9yF8VPU6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp9yF8VPU6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp9yF8VPU6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp9yF8VPU6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp9yF8VPU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp9yF8VPU6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp9yF8VPU6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp9yF8VPU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp9yF8VPU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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