Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm5218F6YH22 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5218F6YH22 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms