Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Aldh3b2E9Q3E1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Aldh3b2E9Q3E1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Aldh3b2E9Q3E1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms