Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms