Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700015F17RikD3YUK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700015F17RikD3YUK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700015F17RikD3YUK8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms