Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap58B2RW38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cfap58B2RW38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap58B2RW38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms