Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc163A2AGD7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms