Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul4bA2A432 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4bA2A432 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4bA2A432 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms