Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ino80eA0A0U1RP99 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80eA0A0U1RP99 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms