Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cited4Q9WUL8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms