Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh13Q9WTR5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh13Q9WTR5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms