Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc3Q9QZC1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpc3Q9QZC1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.7 ms