Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx4Q9QY61 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx4Q9QY61 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx4Q9QY61 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms