Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42ep4Q9JM96 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc42ep4Q9JM96 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc42ep4Q9JM96 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms