Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsmQ9JL96 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsmQ9JL96 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms