Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AtrQ9JKK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AtrQ9JKK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms