Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga3Q9JJZ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cnga3Q9JJZ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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