Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc17Q9ESX4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zcchc17Q9ESX4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zcchc17Q9ESX4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zcchc17Q9ESX4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zcchc17Q9ESX4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms