Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim2Q9ESN6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim2Q9ESN6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim2Q9ESN6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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