Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms