Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem53Q9D0Z3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms