Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acsl3Q9CZW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acsl3Q9CZW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acsl3Q9CZW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acsl3Q9CZW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms