Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb5Q9CQH3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufb5Q9CQH3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms