Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GpnmbQ99P91 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms