Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap4Q99P47 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap4Q99P47 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap4Q99P47 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap4Q99P47 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms