Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprtQ99M80 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PtprtQ99M80 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprtQ99M80 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprtQ99M80 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprtQ99M80 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprtQ99M80 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprtQ99M80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
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