Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rsl24d1Q99L28 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsl24d1Q99L28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsl24d1Q99L28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms