Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slc5a4bQ91ZP4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Slc5a4bQ91ZP4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Slc5a4bQ91ZP4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms