Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha12Q91Y18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdha12Q91Y18 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha12Q91Y18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms