Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d5Q8JZW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d5Q8JZW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d5Q8JZW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2d5Q8JZW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2d5Q8JZW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2d5Q8JZW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d5Q8JZW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms