Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrif1Q8CDD9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrif1Q8CDD9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrif1Q8CDD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrif1Q8CDD9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms