Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Strip2Q8C9H6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Strip2Q8C9H6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Strip2Q8C9H6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms