Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uba3Q8C878 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba3Q8C878 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uba3Q8C878 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms