Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TiparpQ8C1B2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TiparpQ8C1B2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TiparpQ8C1B2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms