Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka5Q8C050 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rps6ka5Q8C050 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rps6ka5Q8C050 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka5Q8C050 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1304.7 ms